Jan-Dirk Döhling studierte Evangelische Theologie in Siegen, Bielefeld-Bethel, Leipzig und Bochum. Nach dem Vikariat in der Evangelischen Kirche von Kurhessen-Waldeck promovierte er in Marburg und war drei Jahre lang Gemeindepfarrer in der Nähe von Kassel. Es folgte eine Juniorprofessur für Religion und Literatur des Alten Testaments an der Ruhruniversität Bochum. 2014 wechselte er als persönlicher Referent der damaligen Präses Annette Kurschus ins Bielefelder Landeskirchenamt, wo er seit 2019 als Landeskirchenrat wirkt.